本室为接收、存放外来被检样品的场所，所有样品均按一定的编号以及类型进行分类，排放置标准台架。
本实验室主要进行碎屑矿物鉴定、重砂鉴定、单矿物挑选、薄片鉴定、微体古生物鉴定及相关工作，并邀请常年从事矿物鉴定工作、古生物鉴定工作的专家进行指导。
洁净实验室将一定空间内空气中的微尘粒子、有害空气、细菌等污染物排除，并将室内的温湿度、洁净度、室内压力、气流速度与气流分布、噪音震动及照明、静电控制在某一需求范围内。
本室配备的仪器设备有液相色谱仪、气相色谱仪、气相色谱-质谱联用仪、离子色谱仪、荧光分光光度计、原子荧光分光光度计、电导率/离子浓度/溶解氧多参数测量仪、全自动凯氏定氮仪等。
本室配备的仪器设备有电感耦合等离子体质谱仪、电感耦合等离子体发射光谱仪。
本室配备的仪器设备有Varian 820-MS电感耦合等离子体质谱仪、Thermo Fisher Scientific Element 2 高分辨电感耦合等离子体质谱仪。
本室配备的仪器设备有激光拉曼光谱仪、微区X射线荧光光谱仪、X射线荧光光谱仪。
有机化学实验室是我中心基础实验室之一，可承担岩石、土壤、植物、环境调查样品、地球化学样品等有机化合物的前处理工作。实验室内台面均有通风设备，实验环境优越。
